Bocian umieszcza swoje gniazdo dość wysoko, zwykle powyżej 5 metrów nad ziemią. Musi być ono duże, aby pomieściło jego potomstwo. Budowę rozpoczyna samiec od układania w wybranym przez siebie miejscu gałęzi. Stara się, aby przynoszony materiał układać tak by klinował się wzajemnie. Te początki nie są dla niego łatwe, gdyż niekiedy z trudem ułożony materiał spada i wszystko trzeba zaczynać od początku. Samica pomaga partnerowi i niebawem powstaje spora platforma z patyków. Tak postrzegamy gniazdo widząc je od dołu, jako zwartą, ubitą kupę drobnych gałęzi. Tymczasem gdy uda nam się zajrzeć do gniazda od góry okazuje się że ma ono zagłębienie, a ptaki wyścieliły nieckę gniazda słomą, sianem, często szmatami, sznurkami, kłączami perzu, trawą, patyczkami i obornikiem. Dzięki temu zbity materiał przypomina klepisko i wysiadywane jaja nie mogą wpaść między gałęzie, ani stoczyć się i wypaść z gniazda. To co wyjątkowe w gnieździe bociana to jego rozmiary. Przez lata dobudowywane te najwyższe osiągają ponad 2 metry i prawie tyle samo średnicy. Gniazda takie choć piękne mogą stanowić zagrożenie dla stabilności obiektu na którym są posadowione.